El CIAPR se organiza en diversos capítulos regionales que representan a sus miembros en diferentes áreas geográficas de Puerto Rico. Cada capítulo funciona como un núcleo local, facilitando la colaboración entre colegiados, promoviendo la formación continua y fomentando el desarrollo profesional dentro de sus respectivas regiones. A través de los capítulos, los colegiados pueden acceder a recursos y eventos personalizados para sus comunidades, fortaleciendo así la conexión entre la institución y las necesidades locales de la ingeniería y la agrimensura.

Los institutos del CIAPR agrupan a los profesionales de cada especialidad dentro de la ingeniería y la agrimensura, proporcionando una plataforma para el desarrollo de conocimientos técnicos y el intercambio de experiencias específicas de cada campo. Desde ingeniería civil hasta ingeniería ambiental y agrimensura, cada instituto aborda las particularidades y retos de su especialidad, promoviendo la excelencia profesional y la innovación en la práctica. Estos institutos son fundamentales para el avance de la profesión, ofreciendo a los colegiados oportunidades de crecimiento y liderazgo dentro de su área de expertise.